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Algorithms for DNA Sequencing
- Individualizado
- Acesso livre
- Certificado pago
- 4 sequências
- Introductive Level
Detalhes do curso
Programa de Estudos
- Week 1 - DNA sequencing, strings and matching
This module we begin our exploration of algorithms for analyzing DNA sequencing data. We'll discuss DNA sequencing technology, its past and present, and how it works. - Week 2 - Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching - Week 3 - Edit distance, assembly, overlaps
This week we finish our discussion of read alignment by learning about algorithms that solve both the edit distance problem and related biosequence analysis problems, like global and local alignment. - Week 4 - Algorithms for assembly
In the last module we began our discussion of the assembly problem and we saw a couple basic principles behind it. In this module, we'll learn a few ways to solve the alignment problem.
Pré-requisito
Instrutores
Ben Langmead, PhD
Assistant Professor
Computer Science
Jacob Pritt
Department of Computer Science
Editor
A Universidade Johns Hopkins (JHU) é uma universidade privada americana situada em Baltimore, Maryland. Tem também campus em Washington, D.C., Bolonha, Itália, Singapura e Nanjing, China. Deve o seu nome a Johns Hopkins, um rico empresário que legou 7 milhões de dólares à universidade aquando da sua morte.
Uma das universidades mais prestigiadas dos Estados Unidos (nomeadamente pelas suas faculdades de medicina e de saúde pública, bem como pela sua escola de assuntos internacionais), a instituição define-se como a principal "universidade de investigação" do país. No início da sua história, inspirou-se principalmente na Universidade de Heidelberg e no modelo educativo alemão de Wilhelm von Humboldt. Em 2019, 39 vencedores do Prémio Nobel têm os seus nomes associados à universidade.
Plataforma
A Coursera é uma empresa digital que oferece um curso on-line massivo e aberto, fundado pelos professores de computação Andrew Ng e Daphne Koller Stanford University, localizado em Mountain View, Califórnia.
O Coursera trabalha com as melhores universidades e organizações para disponibilizar alguns dos seus cursos on-line e oferece cursos em várias disciplinas, incluindo: física, engenharia, humanidades, medicina, biologia, ciências sociais, matemática, negócios, ciência da computação, marketing digital, ciência de dados. e outros assuntos.Cours