Genomic Data Science and Clustering (Bioinformatics V)

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教学大纲

How Did Yeast Become a Wine Maker? (Clustering Algorithms)

 

  • An Evolutionary History of Wine Making
  • Identifying Genes Responsible for the Diauxic Shift
  • Introduction to Clustering
  • k-Means Clustering
  • The Lloyd Algorithm
  • Clustering Genes Implicated in the Diauxic Shift
  • Limitations of k-Means Clustering
  • From Coin Flipping to k-Means Clustering
  • Making Soft Decisions in Coin Flipping
  • Soft k-Means Clustering
  • Hierarchical Clustering
  • Epilogue: Clustering Tumor Samples

What Genetic Characteristics Do Human Populations Share? (Principal Components Analysis)

 

 

  • Specific Content TBA

Bioinformatics Application Challenge: Clustering Biological Big Data (RNA-seq) 

 

先决条件

没有。

讲师

Pavel Pevzner
Professor
Department of Computer Science and Engineering

Phillip Compeau
Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

编辑

加州大学圣地亚哥分校是位于加利福尼亚州圣地亚哥的一所公立赠地研究型大学。加州大学圣地亚哥分校成立于 1960 年,位于斯克里普斯海洋学研究所附近,是加州大学十个校区中最南端的一个,提供 200 多个本科和研究生学位课程,在校本科生 33,096 人,研究生 9,872 人。

加州大学圣地亚哥分校被认为是世界上最好的大学之一。多份出版物将加州大学圣地亚哥分校的生物科学系和计算机科学系评为世界前十名。

平台

Coursera是一家数字公司,提供由位于加利福尼亚州山景城的计算机教师Andrew Ng和达芙妮科勒斯坦福大学创建的大型开放式在线课程。

Coursera与顶尖大学和组织合作,在线提供一些课程,并提供许多科目的课程,包括:物理,工程,人文,医学,生物学,社会科学,数学,商业,计算机科学,数字营销,数据科学 和其他科目。

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