Algorithms for DNA Sequencing

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Their employees are learning daily with

Week 1 - DNA sequencing, strings and matching
This module we begin our exploration of algorithms for analyzing DNA sequencing data. We'll discuss DNA sequencing technology, its past and present, and how it works.
Week 2 - Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching
Week 3 - Edit distance, assembly, overlaps
This week we finish our discussion of read alignment by learning about algorithms that solve both the edit distance problem and related biosequence analysis problems, like global and local alignment.
Week 4 - Algorithms for assembly
In the last module we began our discussion of the assembly problem and we saw a couple basic principles behind it. In this module, we'll learn a few ways to solve the alignment problem.

没有。

Ben Langmead, PhD
Assistant Professor
Computer Science

Jacob Pritt

Department of Computer Science

约翰霍普金斯大学（JHU）是一所美国私立大学，位于马里兰州巴尔的摩市。它在华盛顿特区、意大利博洛尼亚、新加坡和中国南京也设有校区。约翰-霍普金斯大学的名字源于一位富有的企业家约翰-霍普金斯，他在去世时将 700 万美元遗赠给了这所大学。

约翰霍普金斯大学是美国最负盛名的大学之一（尤其是其医学和公共卫生学院以及国际事务学院），它将自己定义为美国领先的 "研究型大学"。建校之初，它主要受到海德堡大学和威廉-冯-洪堡德国教育模式的启发。2019 年，有 39 位诺贝尔奖获得者的名字与这所大学有关2。

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