- From www.coursera.org
Genomic Data Science and Clustering (Bioinformatics V)
- Self-paced
- Free Access
- Fee-based Certificate
- 3 Sequences
- Introductive Level
Course details
Syllabus
How Did Yeast Become a Wine Maker? (Clustering Algorithms)
- An Evolutionary History of Wine Making
- Identifying Genes Responsible for the Diauxic Shift
- Introduction to Clustering
- k-Means Clustering
- The Lloyd Algorithm
- Clustering Genes Implicated in the Diauxic Shift
- Limitations of k-Means Clustering
- From Coin Flipping to k-Means Clustering
- Making Soft Decisions in Coin Flipping
- Soft k-Means Clustering
- Hierarchical Clustering
- Epilogue: Clustering Tumor Samples
What Genetic Characteristics Do Human Populations Share? (Principal Components Analysis)
- Specific Content TBA
Bioinformatics Application Challenge: Clustering Biological Big Data (RNA-seq)
Prerequisite
Instructors
Pavel Pevzner
Professor
Department of Computer Science and Engineering
Phillip Compeau
Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering
Editor
L' Université de Californie à San Diego est une université publique de recherche sur les concessions de terres à San Diego, en Californie. Établi en 1960 près de la Scripps Institution of Oceanography préexistante, l'UC San Diego est le plus méridional des dix campus de l' Université de Californie et offre plus de 200 programmes menant à un diplôme de premier cycle et des cycles supérieurs, recrutant 33 096 étudiants de premier cycle et 9 872 étudiants des cycles supérieurs.
L'UC San Diego est considérée comme l'une des meilleures universités au monde. Plusieurs publications ont classé les départements de sciences biologiques et d'informatique de l'UC San Diego parmi les 10 meilleurs au monde.
Platform
Coursera - это цифровая компания, предлагающая массовые открытые онлайн-курсы, основанные учителями компьютеров Эндрю Нгом и Стэнфордским университетом Дафни Коллер, расположенные в Маунтин-Вью, штат Калифорния.
Coursera работает с ведущими университетами и организациями, чтобы сделать некоторые из своих курсов доступными в Интернете, и предлагает курсы по многим предметам, включая: физику, инженерию, гуманитарные науки, медицину, биологию, социальные науки, математику, бизнес, информатику, цифровой маркетинг, науку о данных и другие предметы.