Bioconductor for Genomic Data Science

Bioconductor for Genomic Data Science

МООК
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Source
  • From www.coursera.org
Conditions
  • Self-paced
  • Free Access
  • Fee-based Certificate
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  • 4 Sequences
  • Introductive Level

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  • Safran
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  • Generali
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Course details

Syllabus

  • Week 1 - Week One
    The class will cover how to install and use Bioconductor software. We will discuss common data structures, including ExpressionSets, SummarizedExperiment and GRanges used across several types of analyses.
  • Week 2 - Week Two
    In this week we will learn how to represent and compute on biological sequences, both at the whole-genome level and at the level of millions of short reads.
  • Week 3 - Week Three
    In this week we will cover Basic Data Types, ExpressionSet, biomaRt, and R S4.
  • Week 4 - Week Four
    In this week, we will cover Getting data in Bioconductor, Rsamtools, oligo, limma, and minfi

Prerequisite

None.

Instructors

Kasper Daniel Hansen, PhD
Assistant Professor, Biostatistics and Genetic Medicine
Bloomberg School of Public Health

Editor

L’université Johns-Hopkins (Johns Hopkins University, ou JHU) est une université privée américaine, située à Baltimore dans le Maryland. Elle possède également des campus à Washington, à Bologne en Italie, à Singapour et à Nankin en Chine. Elle doit son nom à Johns Hopkins, un entrepreneur fortuné qui a légué à sa mort 7 millions de dollars à l'université.

Comptant parmi les universités les plus prestigieuses des États-Unis (surtout pour ses facultés de médecine et de santé publique, ainsi que pour son école d'affaires internationales), l'institution se définit comme la première « université de recherche » du pays. Au début de son histoire, elle s'est principalement inspirée de l'université de Heidelberg et du modèle d'instruction allemand de Wilhelm von Humboldt. En 2019, 39 lauréats du prix Nobel ont leur nom associé à l'université.

Platform

Coursera - это цифровая компания, предлагающая массовые открытые онлайн-курсы, основанные учителями компьютеров Эндрю Нгом и Стэнфордским университетом Дафни Коллер, расположенные в Маунтин-Вью, штат Калифорния.

Coursera работает с ведущими университетами и организациями, чтобы сделать некоторые из своих курсов доступными в Интернете, и предлагает курсы по многим предметам, включая: физику, инженерию, гуманитарные науки, медицину, биологию, социальные науки, математику, бизнес, информатику, цифровой маркетинг, науку о данных и другие предметы.

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