Введение в биоинформатику (Introduction to Bioinformatics)

• Week 1 - Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)
  Первая неделя нашего курса посвящена основным концепциям геномной биоинформатики. Вы узнаете об истории этой дисциплины, основных методах и алгоритмах. Также вас ждет знакомство с реальной лабораторной работой - мы расскажем, как выделяется ДНК и откуда берутс...
• Week 2 - Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)
  Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя будет посвящена обзору методов секвенирования ДНК. Вы узнаете об истории развития этих технологий и принципах, на которых они основаны.
  Welcome to the second week of the course! This week will be d...
• Week 3 - Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)
  На этой неделе вы уже можете приступить к работе над геномным проектом. В лекциях мы поговорим о формате представления исходных данных и контроле качества. Также мы подготовили для вас небольшое введение в операционную систему Linux, так как большинство необхо...
• Week 4 - Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)
  Добро пожаловать на четвертую неделю нашего курса. Она будет посвящена сборке геномов de novo. Вы узнаете о различных подходах к секвенированию малоизученных организмов, и о проблемах, которые при этом возникают. Также мы расскажем о работе алгоримов, использу...
• Week 5 - Неделя 5 - Выравнивание коротких фрагментов (Short read alignment)
  Пятая неделя нашего курса посвящена выравниванию коротких фрагментов на референс - подходу, который используется при работе с уже изученными геномами. В лекциях разбираются наиболее популярные программы для решения таких задач, а также основные алгоритмы для р...
• Week 6 - Неделя 6 - Поиск и аннотация генов (Gene Finding and Annotation)
  В завершающей неделе курса мы разберем методы поиска генов в собранных последовательностях и их аннотации.
  In the final week of the course we will examine methods of gene finding and annotation in assembled sequences.
• Week 7 - Геномный проект (Genome Project)
  В этом практическом задании вам предстоит собрать и проаннотировать бактериальный геном, проинтерпретировать результаты и найти причину ужасной эпидемии, охватившей Европу в 2011 году.
  In this practice challenge you will have to assemble and annotate bacte...

Михаил Райко
Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Екатерина Черняева
Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Alla L Lapidus
Professor, Department of Cytology and Histology
Centre For Algorithmic Biotechnology

Павел Добрынин
Младший научный сотрудник
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Николай Вяххи