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Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente
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Cours
fr
Français
Sous-titres disponibles
25 h
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- Accès libre
- Certificat gratuit
- 10 séquences
- Niveau Intermédiaire
- Sous-titres en English
- Débute le 19 mars 2020
- Clôture le 10 mars 2022
Détails du cours
Déroulé
- Posons le décor : La reproductibilité, en crise ? Reproductibilité et transparence
- Module 1 : Cahier de notes, cahier de laboratoire
- Module 2 : La vitrine et l’envers du décor : le document computationnel
- Module 3 : La main à la pâte : une analyse réplicable
- Module 4 : Vers une étude reproductible : la réalité du terrain
- Let's set the scene : Reproducibility in crisis? Reproducibility and transparency
- Module 1: Taking notes and finding them back
- Module 2: From the showcase to the full story: computational documents
- Module 3: Diving in: a replicable analysis
- Module 4: The rough road to real-life reproducible research
Prérequis
Le premier module ne requiert aucune connaissance particulière. Dès le deuxième module, une connaissance des bases du langage Python (librairies pandas, numpy et matplotlib) ou du langage R est nécessaire.
Si vous ne connaissez pas les librairies Python, n'hésitez pas à suivre le chapitre correspondant du Mooc
Dans le quatrième module, nous traitons des sujets plus spécialisés dont chacun peut nécessiter des compétences particulières.
Une familiarité avec l'analyse de données et les statistiques est nécessaire pour certains exercices de cette session.
Intervenants
Christophe Pouzat
Christophe Pouzat est chercheur CNRS au laboratoire MAP5, mathématiques appliquées à Paris-Descartes. Il est en fait neurophysiologiste et travaille sur l’analyse de données ; la recherche reproductible lui permet une communication explicite avec les expérimentateurs, ce qui évite bien des erreurs.
Arnaud Legrand
Arnaud Legrand est chercheur CNRS au Laboratoire d’Informatique de Grenoble. Il s’intéresse à l’évaluation de la performance de grandes infrastructures. Que ça soit lors de l’expérimentation ou lors de l’analyse des mesures, il est indispensable de capturer rigoureusement le processus utilisé.
Konrad Hinsen
Konrad Hinsen est chercheur CNRS au Centre de Biophysique Moléculaire à Orléans et au Synchrotron SOLEIL à Saint Aubin. Il explore la structure et la dynamique des protéines par des méthodes computationnelles, qu’il tente de rendre reproductibles.
Éditeur
L'Institut national de recherche en informatique et en automatique (Inria) est un établissement public à caractère scientifique et technologique français spécialisé en mathématiques et informatique, placé sous la double tutelle du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation et du ministère de l'Économie et des Finances1 créé le 3 janvier 1967.
L'Inria a pour mission le développement de la recherche et de la valorisation en sciences et techniques de l'information et de la communication, au niveau national comme au plan international. L'institut pilote également la stratégie nationale française en termes de recherche en intelligence artificielle.
Plateforme
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Il opère plusieurs plateformes de diffusion, dont la plus connue, FUN MOOC, est la première plateforme académique francophone mondiale. Grâce à de nombreux établissements partenaires, cette plateforme propose un vaste catalogue de cours s’enrichissant de jour en jour avec des thématiques variées et d’actualité.
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