Genomic Data Science with Galaxy

Genomic Data Science with Galaxy

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  • Sur www.coursera.org
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  • À son rythme
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  • 4 séquences
  • Niveau Introductif

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Détails du cours

Déroulé

  • Week 1 - Introduction
    This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
  • Week 2 - Galaxy 101
    In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
  • Week 3 - Working with sequence data
    In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
  • Week 4 - RNA-seq & Running your own Galaxy
    In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.

Prérequis

Aucun.

Intervenants

James Taylor, PhD
Associate Professor of Biology and Computer Science

Éditeur

L’université Johns-Hopkins (Johns Hopkins University, ou JHU) est une université privée américaine, située à Baltimore dans le Maryland. Elle possède également des campus à Washington, à Bologne en Italie, à Singapour et à Nankin en Chine. Elle doit son nom à Johns Hopkins, un entrepreneur fortuné qui a légué à sa mort 7 millions de dollars à l'université.

Comptant parmi les universités les plus prestigieuses des États-Unis (surtout pour ses facultés de médecine et de santé publique, ainsi que pour son école d'affaires internationales), l'institution se définit comme la première « université de recherche » du pays. Au début de son histoire, elle s'est principalement inspirée de l'université de Heidelberg et du modèle d'instruction allemand de Wilhelm von Humboldt. En 2019, 39 lauréats du prix Nobel ont leur nom associé à l'université.

Plateforme

Coursera est une entreprise numérique proposant des formations en ligne ouverte à tous fondée par les professeurs d'informatique Andrew Ng et Daphne Koller de l'université Stanford, située à Mountain View, Californie.

Ce qui la différencie le plus des autres plateformes MOOC, c'est qu'elle travaille qu'avec les meilleures universités et organisations mondiales et diffuse leurs contenus sur le web.

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