Dynamic Programming: Applications In Machine Learning and Genomics

Dynamic Programming: Applications In Machine Learning and Genomics

Cours
en
Anglais
Sous-titres disponibles
32 h
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Source
  • Sur www.edx.org
Conditions
  • À son rythme
  • Accès libre
  • Certificat payant
Plus d'informations
  • 4 séquences
  • Niveau Intermédiaire
  • Sous-titres en English

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Détails du cours

Déroulé

Week 1: Pairwise Sequence Alignment
A review of dynamic programming, and applying it to basic string comparison algorithms.

Week 2: Advanced Sequence Alignment
Learn how to generalize your dynamic programming algorithm to handle a number of different cases, including the alignment of multiple strings.

Week 3: Introduction to Hidden Markov Models
Learn what a Hidden Markov model is and how to find the most likely sequence of events given a collection of outcomes and limited information.

Week 4: Machine Learning in Sequence Alignment
Formulate sequence alignment using a Hidden Markov model, and then generalize this model in order to obtain even more accurate alignments.

Prérequis

Basic knowledge of:

  • at least one programming language: loops, arrays, stacks, recursion.
  • mathematics: proof by induction, proof by contradiction.

Intervenants

Pavel Pevzner
Ronald R. Taylor Professor of Computer Science
The University of California, San Diego

Phillip Compeau
Assistant Teaching Professor
Carnegie Mellon University

Éditeur

The University of California, San Diego

Plateforme

EdX est une plateforme d'apprentissage en ligne (dite FLOT ou MOOC). Elle héberge et met gratuitement à disposition des cours en ligne de niveau universitaire à travers le monde entier. Elle mène également des recherches sur l'apprentissage en ligne et la façon dont les utilisateurs utilisent celle-ci. Elle est à but non lucratif et la plateforme utilise un logiciel open source.

EdX a été fondée par le Massachusetts Institute of Technology et par l'université Harvard en mai 2012. En 2014, environ 50 écoles, associations et organisations internationales offrent ou projettent d'offrir des cours sur EdX. En juillet 2014, elle avait plus de 2,5 millions d'utilisateurs suivant plus de 200 cours en ligne.

Les deux universités américaines qui financent la plateforme ont investi 60 millions USD dans son développement. La plateforme France Université Numérique utilise la technologie openedX, supportée par Google.

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