Bioinformatics Capstone: Big Data in Biology

Bioinformatics Capstone: Big Data in Biology

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  • Niveau Introductif

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Détails du cours

Déroulé

  • Week 1 - Week 1: Identifying the Culprit in a Food Poisoning Outbreak
    This week, we will apply genome sequencing algorithms to identify the bacterium causing a deadly food poisoning outbreak.
  • Week 2 - Week 2: Comparing Gene Expression in Tissue Samples with RNA-Seq
    In this week's Application Challenge, we will learn how RNA-Sequencing can be applied to perform tissue-level gene expression analysis. In particular, which is more similar on a gene expression level: different tissues from the same organism, or analogous tiss...
  • Week 3 - Week 3: Weighing the Pros and Cons of Whole Genome and Whole Exome Sequencing on a Human Sample
    Comparing the differences between sequencing an entire human genome and sequencing only the exome, or the DNA that is eventually translated into protein. Can we obtain a complete picture of someone's genetic disease predispositions from only the exome, or is ...

Prérequis

Aucun.

Intervenants

Phillip Compeau
Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

Pavel Pevzner
Professor
Department of Computer Science and Engineering

Éditeur

L' Université de Californie à San Diego est une université publique de recherche sur les concessions de terres à San Diego, en Californie. Établi en 1960 près de la Scripps Institution of Oceanography préexistante, l'UC San Diego est le plus méridional des dix campus de l' Université de Californie et offre plus de 200 programmes menant à un diplôme de premier cycle et des cycles supérieurs, recrutant 33 096 étudiants de premier cycle et 9 872 étudiants des cycles supérieurs. 

L'UC San Diego est considérée comme l'une des meilleures universités au monde. Plusieurs publications ont classé les départements de sciences biologiques et d'informatique de l'UC San Diego parmi les 10 meilleurs au monde.

Plateforme

Coursera est une entreprise numérique proposant des formations en ligne ouverte à tous fondée par les professeurs d'informatique Andrew Ng et Daphne Koller de l'université Stanford, située à Mountain View, Californie.

Ce qui la différencie le plus des autres plateformes MOOC, c'est qu'elle travaille qu'avec les meilleures universités et organisations mondiales et diffuse leurs contenus sur le web.

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