Bioconductor for Genomic Data Science

Bioconductor for Genomic Data Science

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  • Sur www.coursera.org
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Détails du cours

Déroulé

  • Week 1 - Week One
    The class will cover how to install and use Bioconductor software. We will discuss common data structures, including ExpressionSets, SummarizedExperiment and GRanges used across several types of analyses.
  • Week 2 - Week Two
    In this week we will learn how to represent and compute on biological sequences, both at the whole-genome level and at the level of millions of short reads.
  • Week 3 - Week Three
    In this week we will cover Basic Data Types, ExpressionSet, biomaRt, and R S4.
  • Week 4 - Week Four
    In this week, we will cover Getting data in Bioconductor, Rsamtools, oligo, limma, and minfi

Prérequis

Aucun.

Intervenants

Kasper Daniel Hansen, PhD
Assistant Professor, Biostatistics and Genetic Medicine
Bloomberg School of Public Health

Éditeur

L’université Johns-Hopkins (Johns Hopkins University, ou JHU) est une université privée américaine, située à Baltimore dans le Maryland. Elle possède également des campus à Washington, à Bologne en Italie, à Singapour et à Nankin en Chine. Elle doit son nom à Johns Hopkins, un entrepreneur fortuné qui a légué à sa mort 7 millions de dollars à l'université.

Comptant parmi les universités les plus prestigieuses des États-Unis (surtout pour ses facultés de médecine et de santé publique, ainsi que pour son école d'affaires internationales), l'institution se définit comme la première « université de recherche » du pays. Au début de son histoire, elle s'est principalement inspirée de l'université de Heidelberg et du modèle d'instruction allemand de Wilhelm von Humboldt. En 2019, 39 lauréats du prix Nobel ont leur nom associé à l'université.

Plateforme

Coursera est une entreprise numérique proposant des formations en ligne ouverte à tous fondée par les professeurs d'informatique Andrew Ng et Daphne Koller de l'université Stanford, située à Mountain View, Californie.

Ce qui la différencie le plus des autres plateformes MOOC, c'est qu'elle travaille qu'avec les meilleures universités et organisations mondiales et diffuse leurs contenus sur le web.

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