Genome Sequencing (Bioinformatics II)

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  • Sur www.coursera.org
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  • 5 séquences
  • Niveau Introductif
  • Sous-titres en Chinese

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Détails du cours

Déroulé

  • Week 1 - Week 1: Introduction to Genome Sequencing

    Welcome to class!

    This course will focus on two questions at the forefront of modern computational biology, along with the algorithmic approaches we will use to solve them in parentheses:

    1. Weeks 1-2: How Do We Assemble Genomes? (Grap...
    2. Week 2 - Week 2: Applying Euler's Theorem to Assemble Genomes

      Welcome to Week 2 of class!

      This week in class, we will see how a 300 year-old mathematical theorem will help us assemble a genome from millions of tiny pieces of DNA.

    3. Week 3 - Week 3: Sequencing Antibiotics

      Welcome to Week 3 of class!

      This week, we begin a new chapter, titled "How Do We Sequence Antibiotics?"  In this chapter, we will learn how to determine the amino acid sequences making up antibiotics using brute force algorithms.

      B...

    4. Week 4 - Week 4: From Ideal to Real Spectra for Antibiotics Sequencing

      Welcome to Week 4 of class!

      Last week, we discussed how to sequence an antibiotic peptide from an ideal spectrum. This week, we will see how to develop more sophisticated algorithms for antibiotic peptide sequencing that are able to handle spectra w...

    5. Week 5 - Week 5: Bioinformatics Application Challenge!
      Welcome to Week 5 of class!This week, we will see how to apply genome assembly tools to sequencing data from a dangerous pathogenic bacterium.

Prérequis

Aucun.

Intervenants

Pavel Pevzner
Professor
Department of Computer Science and Engineering

Phillip Compeau
Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

Éditeur

L' Université de Californie à San Diego est une université publique de recherche sur les concessions de terres à San Diego, en Californie. Établi en 1960 près de la Scripps Institution of Oceanography préexistante, l'UC San Diego est le plus méridional des dix campus de l' Université de Californie et offre plus de 200 programmes menant à un diplôme de premier cycle et des cycles supérieurs, recrutant 33 096 étudiants de premier cycle et 9 872 étudiants des cycles supérieurs. 

L'UC San Diego est considérée comme l'une des meilleures universités au monde. Plusieurs publications ont classé les départements de sciences biologiques et d'informatique de l'UC San Diego parmi les 10 meilleurs au monde.

Plateforme

Coursera est une entreprise numérique proposant des formations en ligne ouverte à tous fondée par les professeurs d'informatique Andrew Ng et Daphne Koller de l'université Stanford, située à Mountain View, Californie.

Ce qui la différencie le plus des autres plateformes MOOC, c'est qu'elle travaille qu'avec les meilleures universités et organisations mondiales et diffuse leurs contenus sur le web.

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