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L’utilisation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques fait partie du quotidien d’un grand nombre de biologistes. Ces structures permettent de comprendre leur fonctionnement, de dessiner des mutants pour étudier leur fonction, de dessiner des molécules pour les bloquer ou les activer.
L’approche majeure pour résoudre la structure tridimensionnelle de macromolécules biologiques est la cristallographie aux rayons X. Ce MOOC est une initiation complète à la cristallographie biologique : depuis l'histoire de la méthode jusqu'à ses outils concrets.Nous vous transmettons nos connaissances et notre expérience par le biais de vidéos théoriques et en situation.
A la fin de ce MOOC vous serez capable :
- d’exploiter les structures tridimensionnelles avec un bon sens critique,
- de résoudre la structure tridimensionnelle d’une macromolécule par cristallographie.
Pour cette nouvelle session, vous pourrez aussi appliquer vos nouvelles connaissances au cours d'une semaine supplémentaire.
Prerequisite
Ce MOOC a été conçu pour des étudiants en biologie à partir du niveau Master, des étudiants en thèse, des stagiaires postdoctorants, des ingénieurs ou chercheurs en biologie. Cependant, quelques bases scientifiques et une bonne dose de curiosité peuvent être suffisants.
Les vidéos peuvent être sous-titrées en français ou en anglais si nécessaire.
Syllabus
Semaine 1 : Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
- Des structures tridimensionnelles : pourquoi faire ?
- Des structures tridimensionnelles : comment faire ?
Semaine 2 : Les fondamentaux de la cristallographie
- Histoire de la cristallographie aux rayons X
- Pourquoi et comment produire des rayons X ?
Semaine 3 : L'échantillon : de sa production à sa cristallisation
- Préparer son échantillon biologique
- Cristalliser une macromolécule biologique
Semaine 4 : Une semaine sur une ligne de lumière du synchrotron SOLEIL
- L'acquisition des données de diffraction
- Le traitement des données de diffraction
Semaine 5 : Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
- Le problèmes des phases
- La résolution de la strucure cristallographique
- La construction, l'interprétation et l'analyse du modèle
Instructors
Marie-Hélène LE DU
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Pierre LEGRAND
Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
Yves MECHULAM
Directeur de Recherche au CNRS, Professeur à l’Ecole polytechnique
Sylvain RAVY
Directeur de Recherche au CNRS Laboratoire de Physique des Solides, Université Paris-Sud
Serena SIRIGU
Scientifique de ligne sur PROXIMA-2, synchrotron SOLEIL
Stéphane Bressanelli
Directeur de recherche au CNRS, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Jean-Baptiste CHARBONNIER
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Léonard CHAVAS
Responsable de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
Bruno ROBERT
Directeur de recherche au CEA, responsable du département biochimie, biophysique et biologie structurale à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Carine TELLIER
Assistante Ingénieur au CEA, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Andrew THOMPSON
Directeur scientifique du synchrotron SOLEIL
Sophie ZINN-JUSTIN
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Content designer
The Université Paris-Saclay (French: Université Paris-Saclay) is a French federal research university which is currently under development. The project is part of the research-intensive and business cluster Paris-Saclay, located near Paris in the Plateau de Saclay. The University of Paris-Saclay is expected to be the training and research center of the Paris-Saclay technology cluster, such as Stanford University in Silicon Valley and the Technion in Israel.
Platform
France Université Numérique is the broadcaster of the online courses of French higher education institutions and their partners.
It operates several platforms of diffusion, of which the best known, FUN MOOC, is the first French-speaking academic platform worldwide. Thanks to many partner institutions, this platform offers a vast catalog of courses enriched daily with various themes and current events.
