list 7 sequences
assignment Level : Introductive
chat_bubble_outline Language : Russian
card_giftcard 112 points
Users' reviews
-
starstarstarstarstar

Key information

credit_card Free access
verified_user Fee-based Certificate
timer 14 hours in total

About the content

Курс «Введение в биоинформатику» адресован тем, кто хочет получить расширенное представление о том, что такое биоинформатика и как она помогает биологам и медикам в их работе. The course is aimed at those who would like to have a better idea of what bioinformatics is and how it helps biologists and medical scientists in research and clinical work.

more_horiz Read more
more_horiz Read less
dns

Syllabus

  • Week 1 - Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)
    Первая неделя нашего курса посвящена основным концепциям геномной биоинформатики. Вы узнаете об истории этой дисциплины, основных методах и алгоритмах. Также вас ждет знакомство с реальной лабораторной работой - мы расскажем, как выделяется ДНК и откуда берутс...
  • Week 2 - Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)
    Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя будет посвящена обзору методов секвенирования ДНК. Вы узнаете об истории развития этих технологий и принципах, на которых они основаны.
    Welcome to the second week of the course! This week will be d...
  • Week 3 - Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)
    На этой неделе вы уже можете приступить к работе над геномным проектом. В лекциях мы поговорим о формате представления исходных данных и контроле качества. Также мы подготовили для вас небольшое введение в операционную систему Linux, так как большинство необхо...
  • Week 4 - Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)
    Добро пожаловать на четвертую неделю нашего курса. Она будет посвящена сборке геномов de novo. Вы узнаете о различных подходах к секвенированию малоизученных организмов, и о проблемах, которые при этом возникают. Также мы расскажем о работе алгоримов, использу...
  • Week 5 - Неделя 5 - Выравнивание коротких фрагментов (Short read alignment)
    Пятая неделя нашего курса посвящена выравниванию коротких фрагментов на референс - подходу, который используется при работе с уже изученными геномами. В лекциях разбираются наиболее популярные программы для решения таких задач, а также основные алгоритмы для р...
  • Week 6 - Неделя 6 - Поиск и аннотация генов (Gene Finding and Annotation)
    В завершающей неделе курса мы разберем методы поиска генов в собранных последовательностях и их аннотации.
    In the final week of the course we will examine methods of gene finding and annotation in assembled sequences.
  • Week 7 - Геномный проект (Genome Project)
    В этом практическом задании вам предстоит собрать и проаннотировать бактериальный геном, проинтерпретировать результаты и найти причину ужасной эпидемии, охватившей Европу в 2011 году.
    In this practice challenge you will have to assemble and annotate bacte...
record_voice_over

Instructors

Михаил Райко
Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Екатерина Черняева
Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Alla L Lapidus
Professor, Department of Cytology and Histology
Centre For Algorithmic Biotechnology

Павел Добрынин
Младший научный сотрудник
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Николай Вяххи

store

Content designer

Saint Petersburg State University
The Saint-Petersburg University (SPbU) is a state university, located in Saint-Petersburg, Russia. Founded in 1724, SPbU is the oldest institution of higher education in Russia. At present, there are more than 25 000 students in SPbU studying over 200 programmes.
assistant

Platform

Coursera

Coursera is a digital company offering massive open online course founded by computer teachers Andrew Ng and Daphne Koller Stanford University, located in Mountain View, California. 

Coursera works with top universities and organizations to make some of their courses available online, and offers courses in many subjects, including: physics, engineering, humanities, medicine, biology, social sciences, mathematics, business, computer science, digital marketing, data science, and other subjects.

You are the designer of this MOOC?
What is your opinion on this resource ?
Content
0/5
Platform
0/5
Animation
0/5